В апреле 2000 года Шэньянский институт прикладной экологии Китайской академии наук начал подготовку к созданию “Центра развития органических продуктов провинции Ляонин”;
В мае 2002 года центр прошёл регистрацию в Торгово-промышленной администрации и был официально переименован в “Ляонин Фанъюань Сертификационную компанию органических продуктов питания с ограниченной ответственностью”.
В июле 2002 года компания получила одобрение бывшего “Государственного комитета по аккредитации органических продуктов питания” (подчинённого бывшему Министерству охраны окружающей среды КНР), начала пробную эксплуатацию и официально приступила к деятельности по сертификации органической продукции;
В 2003 году государство учредило единую систему сертификации и аккредитации, бывшее Главное управление по надзору за качеством, инспекции и карантину КНР сформировало Государственную комиссию по сертификации и аккредитации (CNCA). В сентябре 2004 года FOFCC стала одним из первых органов по сертификации органической продукции, получивших одобрение Государственной комиссии по сертификации и аккредитации, номер одобрения: CNCA-R-2004-122. В том же году была подана заявка на аккредитацию в Китайский национальный комитет по оценке соответствия (CNAS);
В августе 2004 года компания стала членом Международной федерации движений за органическое сельское хозяйство (IFOAM);
В декабре 2005 года компания успешно получила аккредитацию Китайского национального центра по оценке соответствия (CNAS);
В августе 2005 года в целях улучшения условий работы и стремления к разделению функций государства и бизнеса, а также к объективной независимости, FOFCC переехала из офисного здания Шэньянского института прикладной экологии КАН в здание Лиян в Шэньяне и с тех пор осуществляет самостоятельную деятельность;
В 2005 году компания зарегистрировалась в качестве члена Китайской ассоциации сертификации и аккредитации (CCAA);
В 2008 году компания подписала соглашение о субподрядном сотрудничестве с крупнейшим в Латинской Америке органом по сертификации органической продукции IBD, в рамках которого на территории материкового Китая осуществляется субподрядная деятельность по сертификации органической продукции по стандартам ЕС, США и другим стандартам IBD;
В июле 2010 года FOFCC начала выходить на международный рынок и осуществлять международную сертификационную деятельность. На сегодняшний день инспекторы компании направлялись в Таиланд, Пакистан, Индонезию, Монголию, Россию, Южную Корею, Бразилию и другие страны для проведения сертификации по китайским стандартам органической продукции;
В ноябре 2014 года компания впервые прошла офисный аудит и выездной аудит свидетелем со стороны IOAS (Международного комитета по органической и устойчивой аккредитации);
В июле 2017 года офис FOFCC переехал в здание COFCO Plaza в Шэньяне, площадь офисных помещений увеличилась в 2,5 раза, и развитие компании вышло на новый уровень;
В 2019 году компания подписала соглашение о субподрядном сотрудничестве с Тайваньской ассоциацией развития органического сельского хозяйства «Баодао» (FOA) для совместного осуществления на территории материкового Китая деятельности по сертификации по тайваньским органическим стандартам;
В июле 2021 года компания подписала соглашение о субподрядном сотрудничестве с крупнейшим южнокорейским органом по сертификации органической продукции DCOK для осуществления на территории материкового Китая деятельности по сертификации по корейским органическим стандартам;
30 ноября 2021 года FOFCC получила одобрение Министерства сельского, лесного и рыбного хозяйства Японии и официально получила квалификацию органа по сертификации органической продукции по японскому стандарту JAS;
16 июня 2023 года после одобрения Канадского агентства по инспекции пищевых продуктов (CFIA) Международный комитет по органической и устойчивой аккредитации (IOAS) официально выдал FOFCC сертификат аккредитации на канадскую органическую продукцию. Органическая продукция, сертифицированная FOFCC, может на законных основаниях использовать знак сертификации COR и экспортироваться в Канаду. Кроме того, в соответствии с соглашением об эквивалентности органических нормативных актов между правительствами Канады и США, органическая продукция, уже получившая канадскую органическую сертификацию, может использовать органический знак Министерства сельского хозяйства США (USDA) и напрямую экспортироваться в США;
24 марта 2025 года компания официально получила сертификат органической аккредитации ЕС EU2018/848, выданный Международным комитетом по органической и устойчивой аккредитации (IOAS).